猪全基因组50K SNP芯片及应用, 发明专利，申请号: KHP179810156.8；刘剑锋，冯文，杜恒，赵鹏举

       简介：本发明提供一种猪全基因组50K SNP芯片及应用，所述SNP分子标记主要来自于以下三类：第一类，根据已有文献报道的现有重要经济功能基因的显著位点筛选得来SNP位点：第二类，从国内外多个品种测序数据筛选出的多态性良好的SNP位点;第三类，来源于SNP数据库，三类探针共计包含50000个SNP位点。此外，本发明提供的猪全基因组50K SNP芯片，可用于特异性鉴定欧洲猪与亚洲猪，进行全基因组选择育种，目标性状QTL、关联位点及候选基因鉴定，亲缘关系鉴定等方面。

一种与猪乳头内陷相关的SNP标记及其应用，发明专利，授权公告号:CN 110438236 B，刘剑锋，张蕾，郑先瑞，周磊，傅金銮 (专利号： ZL201910486051.2) 专利申请日：2019年6月5日，授权公告日：2020年12月4日

       简介：本发明公开一种与猪乳头内陷相关的SNP标记及其应用，所述SNP分子标记包括以下至少一个位点：（1）是位于猪13号染色体上的MIR138基因，GenBank序列号：NC_010455.5所示序列的27449811bp处，该SNP位点为rs81256086，碱基变化为T/C;（2）是位于猪13号染色体上的ANO10基因，GenBank序列号：NC_010455.5所示序列的26877847bp处，该SNP位点为rs327526761，碱基变化为A/G。上述SNP标记可以应用于检测猪乳头是否内陷和辅助猪育种。

一种估计基因组育种值的方法及装置，发明专利，授权号：CN107563147B；刘剑锋，康慧敏，宁超，张胜利，2019-12-20，ZL201710651753.2
       简介：本发明实施例提供一种估计基因组育种值的方法及装置，该方法包括：根据矩阵M的子块数和预设的MPI进程数n，确定MPI进程MPI读取的根据表型数据文件的记录条数，矩阵A中的个体数和所述MPI进程数n，确定MPI进程MPI读取的系数矩阵W和根据MPI进程MPI的系数矩阵W和确定待估计的基因组育种值。此外本发明实施例可以实现计算机资源与运算速度的最优化，节约运算时间，提高工作效率。

一种母猪综合繁殖力的评价方法及其在猪育种中的应用，发明专利，申请号：201811223761.8，授权公告号：CN109479812B，赵祖凯，杨华威，刘剑锋，周磊，杜房房，曾新斌，方铎，王晔
       简介：本发明公开了一种母猪综合繁殖力的评价方法及其在猪育种中的应用，并引入新母系指数评价母猪的繁殖力;新母系指数是由达100kg体重校正日龄、达100kg体重校正背膘厚、总产仔数和仔猪初生重均匀度分别以30%、30%、30%、10%的权重构成，对于后备母猪，淘汰所有新母系指数低于100的母猪，再根据乳头数和外貌标准淘汰综合繁殖力低的母猪，对于经产母猪，根据总产仔数、泌乳力和新母系指数对母猪进行综合繁殖力评价。此外本发明母猪综合繁殖力的评价方法能够及时淘汰繁殖性能和泌乳力差的母猪，保持核心群母猪的高水平繁殖性能和泌乳性能，加快群体的遗传进展和表型进展，提高育种场及其辐射扩繁母猪场的生产水平和盈利水平。

一种与猪产仔数相关的CNV标记及其应用，发明专利，授权公告号:CN 104846080 B；刘剑锋，杨凯捷，郑先瑞，王海飞  （专利号：ZL201510191179.8）
       简介：本发明提供一种与猪产仔数相关的CNV标记及其应用，所述CNV标记是指猪AHR基因(GenBank：NC_010451.3)候选区域内的拷贝数变异，拷贝数为1或2，表现为拷贝数缺失型和拷贝数正常型。对大白猪繁殖性状和拷贝数的关联分析显示，AHR基因不同拷贝数对其产仔数有显著影响，其中拷贝数为2的个体总产仔数和产活仔数极显著高于拷贝数为1的个体(P<0.01)。本发明还提供了用于检测所述CNV标记的引物及含有该引物的试剂盒以及所述CNV标记在鉴定产仔数高的猪品种中的应用，此外通过本发明获得的CNV可作为大白猪产仔数性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。

一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分相关的SNP标记及其应用，授权公开号：CN103045727B，发明专利，专利号码：201210480570.6；刘剑锋，王海飞，赵红梅，张勤，张胜利
       简介：本发明涉及一种与中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记的位点位于中国荷斯坦奶牛HAL基因如SEQIDNO.1所示序列的197bp位点处，此处位点的碱基为G或A，此处碱基为G的中国荷斯坦奶牛的乳蛋白含量显著高于此处碱基为A的中国荷斯坦奶牛，而体细胞评分前者显著低于后者。本发明还提供了用于检测所述SNP标记的引物及含有该引物的试剂盒，提供了所述SNP标记在鉴定乳蛋白量高、体细胞评分低的中国荷斯坦奶牛优势品种中的应用以及所述SNP标记在中国荷斯坦奶牛分子标记辅助育种中的应用。最后本发明的SNP标记为中国荷斯坦奶牛产奶性状及体细胞评分的标记辅助选择提供了科学依据。