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(一)基本信息


软件名称基于高通量测序数据的可变基因组组装软件

简  称CDpan

登  记 号2022SR0120585      

项目地址:https://github.com/CAU-TeamLiuJF/CDpan


(二)简介


人们越来越认识到代表个体基因组的参考序列不足以捕捉我们在自然界中观察到的基因组多样性。随着短读长测序的发展,可以方便地实现个体的高深度全基因组测序数据。因此,为了帮助研究人员捕获物种内参考基因组中缺失的基因组序列,我们提出CDpan(Constructing dispensable genome for pan-genome analysis)利用高通量测序reads构建可有可无的基因组